秸稈綜合利用仍然存在利用率低、產(chǎn)業(yè)鏈短和產(chǎn)業(yè)布局不合理等問題。存在這些問題的主要原因：

一、是對秸稈綜合利用認(rèn)識不足。一些地區(qū)沒有把秸稈真正作為資源來看待，缺乏統(tǒng)籌規(guī)劃，綜合利用推進(jìn)不力。

二、是秸稈資源與利用現(xiàn)狀不清。長期以來，由于對秸稈利用的重視程度不夠等原因，盡管有關(guān)部門和專家開展了一些調(diào)查和分析工作，但仍存在著秸稈資源不清、利用現(xiàn)狀不明等問題。

三、是市場化機(jī)制不完善，缺乏政策激勵(lì)。目前，各地還沒有建立有效的市場機(jī)制和儲(chǔ)運(yùn)體系，秸稈商品化水平低，缺乏鼓勵(lì)秸稈綜合利用的具體政策措施，秸稈產(chǎn)業(yè)發(fā)展滯后。

四、是缺乏農(nóng)民經(jīng)濟(jì)實(shí)用的配套技術(shù)設(shè)備。在農(nóng)作物輪作茬口緊的多熟農(nóng)區(qū)，秸稈便捷處理設(shè)施不配套，農(nóng)民收集處理秸稈的難度大，隨意遺棄和露天焚燒現(xiàn)象嚴(yán)重；秸稈綜合利用新技術(shù)應(yīng)用規(guī)模較小，尤其是適宜農(nóng)戶分散經(jīng)營的小型化、實(shí)用化技術(shù)缺乏，各項(xiàng)技術(shù)之間集成組合不夠。